5 Vorteile automatisierter RNA-Extraktion

*Anzeige – in Zusammenarbeit mit BioEcho Life Sciences

Von der Expressionsanalyse und Klonierung bis hin zur molekularen Diagnostik bildet die RNA-Extraktion den ersten Schritt bei vielen wichtigen Anwendungen. Tatsächlich ist die RNA-Extraktion ein grundlegendes Verfahren bei der quantitativen PCR mit reverser Transkriptase (RT-qPCR) - dem Goldstandard für COVID-19-Tests.

Folglich wurden seit Beginn der Pandemie Milliarden von RNA-Extraktionen für COVID-19-Tests durchgeführt und die Hochdurchsatzanalyse hat auch schon in den letzten Jahren an Bedeutung gewonnen.

Mit der gigantischen Anzahl von RNA-Extraktionen geht eine riesige Anzahl von Pipettier- und anderen manuellen Schritten einher, von denen jeder eine Möglichkeit für Fehler und Kontaminationen darstellt; ganz zu schweigen von dem enormen Zeit- und Arbeitsaufwand.

Automatisierte RNA-Extraktion kann viele dieser Limitierungen überwinden. Indem Sie die Kontrolle an einen Pipettierroboter abgeben, können Sie die Genauigkeit und Reproduzierbarkeit Ihrer Ergebnisse erhöhen, die Produktivität drastisch steigern und viel Zeit sparen. Im Folgenden erläutern wir 5 Vorteile der automatisierten RNA-Extraktion.

1. Zeitersparnis und höherer Durchsatz

Fast jeder im Life Sciences-Bereich, vom Wissenschaftler bis zum Technischen Assistenten, hat schon einmal frustriert mit der Pipette in der Hand vor einer Mikrotiterplatte gesessen und festgestellt, wie viel Zeit und Konzentration für die erfolgreiche Durchführung des Experiments erforderlich sind.

Bei der automatisierten RNA-Extraktion passiert das nicht mehr: Der Anwender drückt vereinfacht gesagt einen Knopf und kann gehen. Außerdem pipettieren Roboter in der Regel schneller als Menschen und können mehr Proben auf einmal verarbeiten. Dies kann vor allem in biopharmazeutischen oder diagnostischen Laboren von großem Vorteil sein, wo die schnelle Verarbeitung einer großen Anzahl von Proben sehr wichtig ist. Mit einem Roboter, der die sich wiederholenden Abläufe übernimmt, können Sie sich so auf andere wichtige Aspekte Ihrer Arbeit konzentrieren!

Je mehr Proben mit hoher Geschwindigkeit verarbeitet werden, desto größer ist der Effekt, den Probenumfang für eine effizientere Diagnostik zu erhöhen oder auch den Umfang Ihrer Forschung zu auszudehnen. Wenn das Ziel Ihrer RNA-Extraktion beispielsweise die Expressionsanalyse ist, können Sie mehr Bedingungen untersuchen, die die Transkription modulieren können. In einem Biopharma-Labor bedeutet ein größerer Probenpool, dass Sie mehr potenzielle Zielmoleküle in kürzerer Zeit untersuchen können, und wenn Sie in einem Diagnostiklabor arbeiten, trägt die Automatisierung dazu bei, effiziente und genaue Diagnosen zu stellen.

Wenn Sie Ihre Proben noch schneller verarbeiten wollen, ist das dank innovativer RNA-Extraktionstechnologie möglich. BioEcho hat beispielsweise eine innovative Ein-Schritt-RNA-Extraktionstechnik entwickelt, die halbautomatisch durchgeführt werden kann und bis zu dreimal schneller ist als herkömmliche Methoden auf Silica-Basis.

Erfahren Sie hier mehr über die schnelle Nukleinsäure-Extraktionstechnologie von BioEcho.

2. Reduzieren Sie Fehler und erhöhen Sie die Reproduzierbarkeit

Das Sprichwort "Irren ist menschlich" drückt aus, dass es für Menschen natürlich ist, Fehler zu machen. Und unabhängig von Ihrer Erfahrung im Labor oder Ihrer Vertrautheit mit einem bestimmten Protokoll können manchmal Fehler passieren.

Die Fehlerwahrscheinlichkeit erhöht sich, wenn Protokolle zwischen Kollegen oder zwischen verschiedenen Laboren ausgetauscht werden. Unabhängig davon, ob Sie versuchen, ein Protokoll aus einer von Fachleuten begutachteten Arbeit oder aus den Notizen Ihrer Kollegen zu replizieren, gibt es viel Raum für Interpretationen - und das kann zu Abweichungen zwischen Experimenten, Durchführenden oder Laboren führen.

Die Automatisierung der RNA-Extraktion reduziert die Anzahl der menschlichen "Berührungspunkte" und minimiert folglich das Risiko menschlicher Fehler, insbesondere wenn es um das Pipettieren kleiner Volumina oder viskoser Proben geht. Darüber hinaus können programmierbare, automatisierte Extraktionsprotokolle innerhalb eines Labors und laborübergreifend gemeinsam genutzt werden, was zu einer höheren Datengenauigkeit, Reproduzierbarkeit und Zuverlässigkeit führt.

3. Eine saubere Sache: Kontaminationen vermeiden

RNasen sind der Erzfeind einer erfolgreichen RNA-Extraktion. Diese Enzyme katalysieren den Abbau von RNA und können Ihre Proben in kürzester Zeit vollständig zerstören. Darüber hinaus sind sie überall! RNase-Kontaminationen zu vermeiden hat daher bei jedem RNA-Isolierungsprotokoll höchste Priorität.

Durch die Automatisierung der RNA-Extraktion und die Minimierung der manuellen Arbeitsschritte wird das Kontaminationsrisiko erheblich reduziert. Dies hilft nicht nur, Ihre wertvollen RNA-Proben vor abbauenden Enzymen zu schützen, sondern auch vor kontaminierter RNA, die zu fehlerhaften Ergebnissen in Ihren nachgeschalteten Anwendungen führen könnte.

4. Nichts zu melden? Das liegt daran, dass es automatisiert ist!

Neben der Bearbeitung einer großen Anzahl von Proben wird von Wissenschaftlern im Allgemeinen erwartet, dass sie ein akribisches, gut organisiertes Labornotizbuch führen. Aber wir alle sind schon einmal auf halbem Weg durch ein Protokoll gestolpert und haben nach einem Stück Papier gegriffen, um ein wichtiges, aber leicht zu vergessendes Detail zu notieren.

Bei der automatisierten RNA-Extraktion wird jeder Schritt des Prozesses automatisch aufgezeichnet und elektronisch gespeichert. Wenn Sie also Ihren Versuchsplan schreiben müssen, können Sie sicher sein, dass Sie alle wichtigen Details immer zur Hand haben. Und wenn die Zusammenarbeit im Vordergrund steht, lassen sich Methoden und Programme einfach und präzise zwischen den Laboren austauschen. Ganz gleich, ob Sie einfach nur ein Protokoll übertragen oder eine größere Anzahl von Experimenten durchführen wollen, die Automatisierung Ihrer Arbeitsabläufe sollte eine Priorität sein.

5. Pipettieren ist mühsam - reduzieren Sie sich wiederholende Belastungen

Aus der Perspektive eines unerfahrenen Auges mag das Pipettieren nicht sehr anstrengend erscheinen. Das stundenlange Hocken über einer Mikrotiterplatte kann jedoch leicht zu Nacken- und Rückenproblemen, Schmerzen und Steifheit in den Händen sowie zu Ermüdung führen. Arbeitsbedingte Verletzungen können die Produktivität beeinträchtigen, das Risiko von Versuchsfehlern erhöhen und Kosten für krankheitsbedingte Fehlzeiten verursachen.

Noch besorgniserregender ist die Tatsache, dass Syndrome wie RSI (Repetitive Strain Injury) häufig auf übermäßiges Pipettieren zurückzuführen sind und unbehandelt zu Lähmungen führen können. Warum also RSI riskieren, wenn ein Roboter diese sich wiederholenden Aufgaben für Sie übernehmen kann?

Grenzen der Automatisierung

Die Laborautomatisierung bietet zwar einige eindeutige und bedeutende Vorteile, doch die Einrichtung von Protokollen, die auf Ihre Anwendung zugeschnitten sind, kann auch viel Zeit in Anspruch nehmen. Glücklicherweise entwickeln die Anbieter zunehmend fertige Kits, die mit automatisiertem Liquid Handling kompatibel sind - wie das EchoLUTION Viral RNA/DNA Swab 96 Kit Plus von BioEcho.

Dennoch stellen die hohen Kosten für die Etablierung einer Automatisierung für viele Labore eine unüberwindbare Hürde dar. Darüber hinaus sind große Projekte, die einen hohen Durchsatz erfordern, in einigen Forschungslabors möglicherweise nur eine vorübergehende Notwendigkeit. Folglich sind die hohen Anfangskosten möglicherweise nicht gerechtfertigt. In diesen Fällen ist es dennoch möglich, die Vorteile der Automatisierung zu nutzen, indem Sie Ihre Hochdurchsatz-Extraktionen auslagern.

Bei BioEcho nutzen wir unser umfassendes Fachwissen, um Ihnen einen flexiblen und skalierbaren Service und eine unübertroffene Unterstützung für jeden Schritt Ihres Automatisierungsworkflows zu bieten - von der ersten Idee und dem experimentellen Aufbau bis hin zur Fehlerbehebung und kontinuierlichen Optimierung. Kontaktieren Sie uns, um Ihre Automatisierungsanforderungen zu besprechen.

Veröffentlicht: 21.04.2022